中山醫(yī)大團隊上泌尿道上皮癌早期檢測方案 iGEM榮耀摘金
中山醫(yī)大CSMU_Taiwan iGEM 優(yōu)秀團隊成員。圖：中山醫(yī)大提供
由麻省理工學院於2004年首創(chuàng)之國際遺傳工程機器設(shè)計競賽iGEM(International Genetically Engineered Machine Competition)是每年全球最大的合成生物學競賽，各國大學相關(guān)科系的人才皆會組隊報名，競爭相當激烈。由於今年國際移動仍深受新型冠狀病毒(COVID-19)疫情影響，競賽係採線上方式進行，於臺灣時間11月4日至11月14日進行本年度賽事。本次競賽共有約320個隊伍參與，臺灣區(qū)大學組為中山醫(yī)學大學、國立陽明交通大學、國立清華大學、國立中興大學、國立中正大學、國立成功大學共7支隊伍參賽。在iGEM競賽期間，參賽者需以合成生物學技術(shù)為主，結(jié)合工程、物理、計算機科學以及其他多項領(lǐng)域能力，提出一項具新穎且經(jīng)實驗證實的合成生物學技術(shù)，解決包含醫(yī)學檢測、食品營養(yǎng)、環(huán)境汙染處理等多項人類社會面臨的問題。
本校中山醫(yī)學大學團隊CSMU_Taiwan由校內(nèi)學生組成，以生醫(yī)系三年級學生陳冠宏(隊長)、醫(yī)學系二年級學生李唯綾(副隊長)為首，成員分別為醫(yī)學系二年級學生石嘉憲、劉芃忻、歐哲瑀，生醫(yī)系三年級學生阮亮學，醫(yī)技系二年級學生蘇歆媛共7名團員。繼 2017 年「中山醫(yī)大×中興大學聯(lián)隊(CSMU_NCHU_Taiwan)」、2019 年「中山醫(yī)大團隊(CSMU_Taiwan)」以及2020 年「中山醫(yī)大團隊(CSMU_Taiwan)」參賽並榮獲金牌殊榮之後，今年中山醫(yī)大團隊(CSMU_Taiwan)也在校內(nèi)師長的指導與校內(nèi)外單位的大力支持下，今年團隊設(shè)計為體外上泌尿道上皮癌早期檢測試劑組GotCha，延續(xù)中山醫(yī)學大學於國際生物競賽亮眼表現(xiàn)；獲得iGEM大會大學組金牌殊榮肯定，以及入圍特殊獎項最佳軟體工具獎(Best Software Tool)。
judguing session。圖：中山醫(yī)大提供
上泌尿道上皮癌為國內(nèi)泌尿道癌中較難於早期被檢測到的一種癌癥，延遲治療的情況導致該癌癥死亡率居高不下。經(jīng)研究證實洗腎患者罹患上泌尿道上皮癌比例相當高，而國內(nèi)普遍慢性腎臟病患者、洗腎患者人口比例為世界第一，這也說明了臺灣腎臟相關(guān)疾病的診斷以及治療需要更加完善。現(xiàn)行電腦斷層(CT)、核磁共振攝影(MRI)以及泌尿道鏡作為上泌尿道上皮癌的檢測，就早期檢測的檢測需求來說：電腦斷層準確性低、核磁共振攝影顯影劑具引起腎功能不良患者產(chǎn)生腎因性全身纖維化癥之危險併發(fā)癥以及泌尿道鏡侵入性過高等問題。因此，中山醫(yī)學大學iGEM團隊CSMU_Taiwan研發(fā)出一套針對上泌尿道上皮癌的體外早期檢測GotCha，協(xié)助該癌癥高風險族群於癌癥能及早發(fā)現(xiàn)以及提供應(yīng)對治療，期望能大幅降低上泌尿道上皮癌患者死亡率。受試者只需提供血液檢體，利用檢測試劑組中特殊設(shè)計的序列作用，即可利用螢光染劑染色結(jié)果判讀該患者的罹癌狀況，可作為上泌尿道上皮癌之早期檢測以及手術(shù)預(yù)後的追蹤。此外，CSMU_Taiwan中的乾實驗室負責人，生醫(yī)系三年級的阮亮學利用Python設(shè)計出檢測中應(yīng)用的序列擴增技術(shù)對應(yīng)的序列設(shè)計軟體Circular DNA Sequence Design，大幅縮減序列設(shè)計的耗時，也同時獲得大會評審的青睞，入圍特殊獎項最佳軟體工具獎(Best Software Tool)。
感謝所有相關(guān)指導教授的指導，包含中山醫(yī)大生醫(yī)系劉玉凡教授(團隊指導教授)、張文瑋教授、楊建洲教授、謝家慶教授、醫(yī)學科技學院院長李明偉教授、醫(yī)技系謝明昌教授、李瑤玲教授、醫(yī)研所謝逸憲教授、醫(yī)研所兼任助理教授陳沛鴻老師(團隊實驗指導老師)等人。也再次感謝所有團隊技術(shù)顧問，包含中山醫(yī)大醫(yī)管系三年級學生李約成、醫(yī)資系四年級學生林郁恩、李映萱、許瑋蕓、生醫(yī)系三年級學生廖得宇。特別感謝中山醫(yī)學大學醫(yī)學系、醫(yī)學科技學院、中山醫(yī)學大學校友總會、孫亞夫醫(yī)學推廣基金會、成杏醫(yī)學文教基金會、強生化學製藥、偉喬生醫(yī)等各界單位的熱情贊助以及支持。
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