1.修正草案說明，因多數生技醫藥公司尚無應納稅額可適用此項投資抵減，留存之可抵減金額甚多，故將研發支出與人才培訓支出抵減率一律調降為30%，且取消「超過前2年度平均數部分可適用50%抵減率」的優惠。但此項投資抵減的適用，是「自有應納營所稅年度」起5年內抵減，應無留存年限的時效，故建議仍應維持現行抵減率的規定，以符合獎勵生技產業研發升級之政策意旨。

2.草案新增，個人股東以現金投資生技公司若符合相關規定，得於投資金額50%限度內自綜合所得總額中減除，且「無抵減金額上限」。此規定與產創條例第23之2的天使投資人租稅優惠類似，但產創條例有「減除限額300萬元」的限制；因草案也同時新增同一事項不得重覆享有租稅優惠的規定，建議個人投資者應慎選有利之租稅優惠來適用，若從抵減金額來看，生技條例修正草案給予的無抵減限額，會比產創條例更優惠。

3.此次修正草案，比照產創修例的員工獎酬及技術入股孰低緩課精神，增列公司高階專業人員及技術投資人持股達2年者，在轉讓時可按轉讓價格與取得股票價格(技術入股)/取得或可處分之日時價(認股權)，二者孰低課稅，且修正草案並未要求公司高階專業人員在公司服務需滿2年的限制。而所謂高階專業人員指具備生技醫藥相關專業，且擔任公司執行長或經理人以上職務之人員；另技術投資人可舉證主張相關成本列為所得減項，若無法舉證則以轉讓價格的30%計算成本。

4.修正草案增列生技新藥公司最近3年因嚴重違反環境保護、勞工或食品安全衛生相關法律且情節重大者，不得適用獎勵、補助或租稅優惠；此項資格限定原列於『生技新藥公司研究與發展及人才培訓支出適用投資抵減辦法』的申請要件，此次修正列入母法，擴大適用於所有獎勵、補助或租稅優惠。

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